Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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APOFQ13790 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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APOFQ13790 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
APOFQ13790 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
APOFQ13790 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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