Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SKP2Q13309 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SKP2Q13309 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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