Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CALCOCO2Q13137 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms