Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXO1Q12778 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms