Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN9O95484 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CLDN9O95484 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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