Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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