Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4Q9P0V3 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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