Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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SAMD8Q96LT4 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SAMD8Q96LT4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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SAMD8Q96LT4 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SAMD8Q96LT4 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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