Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
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