Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDKN3Q16667 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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