Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VAMP3Q15836 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 510.3 ms