Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CYTH1Q15438 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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