Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PDCD1Q15116 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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