Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NCF4Q15080 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms