Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TMED1Q13445 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms