Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NME3Q13232 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NME3Q13232 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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NME3Q13232 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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NME3Q13232 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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