Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TROQ12816 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TROQ12816 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TROQ12816 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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