Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ERVV-1B6SEH8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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