Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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HOXC10Q9NYD6 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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HOXC10Q9NYD6 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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HOXC10Q9NYD6 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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HOXC10Q9NYD6 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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HOXC10Q9NYD6 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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HOXC10Q9NYD6 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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HOXC10Q9NYD6 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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HOXC10Q9NYD6 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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