Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SALL3Q9BXA9 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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