Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms