Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ZBED9Q6R2W3 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ZBED9Q6R2W3 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ZBED9Q6R2W3 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZBED9Q6R2W3 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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