Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
C1orf140Q5VVS0 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
C1orf140Q5VVS0 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms