Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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IMPG1Q17R60 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IMPG1Q17R60 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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IMPG1Q17R60 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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IMPG1Q17R60 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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IMPG1Q17R60 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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IMPG1Q17R60 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
IMPG1Q17R60 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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