Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TAF1AQ15573 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TAF1AQ15573 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TAF1AQ15573 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TAF1AQ15573 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TAF1AQ15573 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TAF1AQ15573 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TAF1AQ15573 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms