Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHHQ15465 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHHQ15465 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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