Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SYCP1Q15431 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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