Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RYR3Q15413 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RYR3Q15413 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 645.8 ms