Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KARSQ15046 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KARSQ15046 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KARSQ15046 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KARSQ15046 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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