Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEMA3AQ14563 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEMA3AQ14563 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms