| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1114P-201 | ENST00000516022 | 107 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EIF4A1P12-201 | ENST00000551910 | 141 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007336.1-201 | ENST00000576365 | 3828 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR5695-201 | ENST00000579717 | 85 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4423-201 | ENST00000580922 | 80 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3133-201 | ENST00000583157 | 78 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356575.1-201 | ENST00000603008 | 283 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNRPGP20-201 | ENST00000604477 | 205 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCGEM1.1-201 | ENST00000613431 | 131 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC023490.1-201 | ENST00000614584 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011718.1-201 | ENST00000622906 | 375 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC130466.1-201 | ENST00000636354 | 4683 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RGS18-201 | ENST00000367460 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-90P-201 | ENST00000362773 | 141 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNY4P28-201 | ENST00000365281 | 93 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.418-201 | ENST00000384029 | 102 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-125P-201 | ENST00000384505 | 107 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR329-1-201 | ENST00000385028 | 80 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO2P33-201 | ENST00000402100 | 465 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.626-201 | ENST00000411288 | 95 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | COX6CP10-201 | ENST00000416832 | 224 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL136320.1-201 | ENST00000417273 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093423.2-201 | ENST00000429074 | 437 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104332.1-201 | ENST00000440471 | 797 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009237.7-201 | ENST00000447357 | 229 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-58P-201 | ENST00000517143 | 103 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4ATAC17P-201 | ENST00000517272 | 120 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IGLV3-17-201 | ENST00000519099 | 244 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC087441.2-201 | ENST00000529141 | 262 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR5092-201 | ENST00000583139 | 88 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006504.5-204 | ENST00000592404 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD14A-201 | ENST00000606526 | 91 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U4atac.1-201 | ENST00000618345 | 95 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | WARS-244 | ENST00000627608 | 123 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL160287.1-202 | ENST00000638113 | 454 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RTL4-201 | ENST00000340433 | 2613 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MAP4K3-205 | ENST00000437545 | 3924 nt | TSL 5 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CLLU1-201 | ENST00000378485 | 3897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DNAH7-201 | ENST00000312428 | 12394 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.44-201 | ENST00000362676 | 108 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-545P-201 | ENST00000362681 | 104 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.122-201 | ENST00000363331 | 96 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA25.6-201 | ENST00000364121 | 118 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFA7P-201 | ENST00000382676 | 285 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA46.1-201 | ENST00000391069 | 153 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP201-201 | ENST00000410316 | 124 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.793-201 | ENST00000411222 | 111 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC063976.3-201 | ENST00000426849 | 329 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL138752.1-201 | ENST00000452964 | 351 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-120P-201 | ENST00000459334 | 63 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC137770.1-201 | ENST00000504620 | 530 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-861P-201 | ENST00000516745 | 106 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC121758.2-201 | ENST00000553271 | 193 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL21P9-201 | ENST00000556149 | 474 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3910-1-201 | ENST00000580936 | 111 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ST7-AS1_1.1-201 | ENST00000611142 | 116 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005296.1-201 | ENST00000616145 | 209 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL590240.4-201 | ENST00000616908 | 390 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EVI2B-201 | ENST00000330927 | 1999 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TMPRSS11A-201 | ENST00000334830 | 3054 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ENAM-201 | ENST00000396073 | 5679 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR6073-201 | ENST00000352083 | 89 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-626P-201 | ENST00000363354 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP125-201 | ENST00000364843 | 120 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-20P-201 | ENST00000384106 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-746P-201 | ENST00000384112 | 109 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1145P-201 | ENST00000384246 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.506-201 | ENST00000384494 | 102 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.570-201 | ENST00000384750 | 101 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-159P-201 | ENST00000391080 | 106 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.597-201 | ENST00000410463 | 100 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC121342.1-201 | ENST00000423914 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SMG7-AS1-202 | ENST00000432837 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL161788.1-201 | ENST00000441805 | 169 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MRPS10P1-201 | ENST00000448483 | 130 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL109933.2-201 | ENST00000452651 | 260 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SRI-210 | ENST00000490437 | 570 nt | TSL 2 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC020703.1-201 | ENST00000505051 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010210.1-203 | ENST00000513905 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP320-201 | ENST00000516263 | 124 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNY3P16-201 | ENST00000516338 | 101 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP002392.1-201 | ENST00000537692 | 208 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC245748.3-201 | ENST00000588710 | 241 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01533-205 | ENST00000593056 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL713866.2-201 | ENST00000603579 | 219 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNRD1-AS1_2.5-201 | ENST00000614729 | 76 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TAB3-205 | ENST00000378933 | 6671 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GPR22-201 | ENST00000304402 | 2942 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DNAH14-210 | ENST00000439375 | 13548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TANK-201 | ENST00000259075 | 2152 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF204P-201 | ENST00000416749 | 2397 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD115-8-201 | ENST00000363856 | 82 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA3A-201 | ENST00000364113 | 130 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.292-201 | ENST00000364904 | 97 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD115-38-201 | ENST00000365037 | 82 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA6-201 | ENST00000384033 | 151 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.464-201 | ENST00000384282 | 110 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR1294-201 | ENST00000408503 | 142 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |