Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ALCAMQ13740 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ALCAMQ13740 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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