Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HDAC1Q13547 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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