Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ATRQ13535 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ATRQ13535 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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ATRQ13535 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATRQ13535 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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