Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TMED1Q13445 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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TMED1Q13445 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TMED1Q13445 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TMED1Q13445 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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