Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CPSF1Q10570 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
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