Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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PTPRBP23467 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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PTPRBP23467 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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PTPRBP23467 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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