Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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