Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CITED1Q99966 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CITED1Q99966 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms