Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDKN3Q16667 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CDKN3Q16667 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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