Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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SGCAQ16586 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
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