Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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