Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KARSQ15046 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KARSQ15046 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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