Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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