Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMC1AQ14683 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMC1AQ14683 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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