Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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FOXE3Q13461 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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