Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SKP2Q13309 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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SKP2Q13309 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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SKP2Q13309 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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SKP2Q13309 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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SKP2Q13309 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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SKP2Q13309 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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