Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECH1Q13011 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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