Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TROQ12816 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TROQ12816 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TROQ12816 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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