Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NUP160Q12769 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
NUP160Q12769 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms