Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms